Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsc1Q9EP53 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tsc1Q9EP53 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsc1Q9EP53 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsc1Q9EP53 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsc1Q9EP53 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tsc1Q9EP53 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tsc1Q9EP53 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tsc1Q9EP53 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tsc1Q9EP53 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tsc1Q9EP53 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tsc1Q9EP53 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tsc1Q9EP53 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tsc1Q9EP53 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tsc1Q9EP53 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tsc1Q9EP53 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tsc1Q9EP53 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tsc1Q9EP53 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms