Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpne8Q9DC53 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpne8Q9DC53 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpne8Q9DC53 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpne8Q9DC53 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpne8Q9DC53 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpne8Q9DC53 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpne8Q9DC53 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpne8Q9DC53 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpne8Q9DC53 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpne8Q9DC53 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cpne8Q9DC53 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne8Q9DC53 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpne8Q9DC53 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne8Q9DC53 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cpne8Q9DC53 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpne8Q9DC53 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms