Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ergic1Q9DC16 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ergic1Q9DC16 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ergic1Q9DC16 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic1Q9DC16 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic1Q9DC16 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic1Q9DC16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ergic1Q9DC16 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ergic1Q9DC16 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ergic1Q9DC16 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ergic1Q9DC16 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ergic1Q9DC16 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ergic1Q9DC16 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ergic1Q9DC16 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ergic1Q9DC16 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms