Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syvn1Q9DBY1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syvn1Q9DBY1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syvn1Q9DBY1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syvn1Q9DBY1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syvn1Q9DBY1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syvn1Q9DBY1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syvn1Q9DBY1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syvn1Q9DBY1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syvn1Q9DBY1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syvn1Q9DBY1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syvn1Q9DBY1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syvn1Q9DBY1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syvn1Q9DBY1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms