Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBN9

Ddx59, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX59, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx59Q9DBN9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx59Q9DBN9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx59Q9DBN9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx59Q9DBN9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx59Q9DBN9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx59Q9DBN9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx59Q9DBN9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx59Q9DBN9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx59Q9DBN9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx59Q9DBN9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx59Q9DBN9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx59Q9DBN9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx59Q9DBN9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx59Q9DBN9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx59Q9DBN9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx59Q9DBN9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx59Q9DBN9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx59Q9DBN9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx59Q9DBN9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx59Q9DBN9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx59Q9DBN9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx59Q9DBN9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx59Q9DBN9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx59Q9DBN9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx59Q9DBN9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms