Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cab39lQ9DB16 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cab39lQ9DB16 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cab39lQ9DB16 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cab39lQ9DB16 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cab39lQ9DB16 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms