Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cmtm2aQ9DAR1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cmtm2aQ9DAR1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm2aQ9DAR1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cmtm2aQ9DAR1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cmtm2aQ9DAR1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm2aQ9DAR1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm2aQ9DAR1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm2aQ9DAR1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm2aQ9DAR1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm2aQ9DAR1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms