Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rsph3bQ9DA80 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rsph3bQ9DA80 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rsph3bQ9DA80 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rsph3bQ9DA80 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms