Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmbim4Q9DA39 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmbim4Q9DA39 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmbim4Q9DA39 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmbim4Q9DA39 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmbim4Q9DA39 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmbim4Q9DA39 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmbim4Q9DA39 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms