Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf138rt1Q9D9M9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf138rt1Q9D9M9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf138rt1Q9D9M9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf138rt1Q9D9M9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf138rt1Q9D9M9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf138rt1Q9D9M9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf138rt1Q9D9M9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf138rt1Q9D9M9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf138rt1Q9D9M9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf138rt1Q9D9M9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf138rt1Q9D9M9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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