Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lin37Q9D8N6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lin37Q9D8N6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lin37Q9D8N6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lin37Q9D8N6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lin37Q9D8N6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lin37Q9D8N6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lin37Q9D8N6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lin37Q9D8N6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lin37Q9D8N6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lin37Q9D8N6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lin37Q9D8N6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms