Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8M3

Slc48a1, Heme transporter HRG1, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc48a1Q9D8M3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc48a1Q9D8M3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc48a1Q9D8M3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc48a1Q9D8M3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc48a1Q9D8M3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc48a1Q9D8M3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc48a1Q9D8M3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc48a1Q9D8M3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc48a1Q9D8M3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc48a1Q9D8M3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc48a1Q9D8M3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc48a1Q9D8M3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc48a1Q9D8M3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms