Protein–RNA interactions for Protein: Q9D864

Actr6, Actin-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr6Q9D864 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actr6Q9D864 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actr6Q9D864 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actr6Q9D864 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actr6Q9D864 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actr6Q9D864 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actr6Q9D864 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Actr6Q9D864 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actr6Q9D864 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Actr6Q9D864 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actr6Q9D864 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actr6Q9D864 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actr6Q9D864 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr6Q9D864 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr6Q9D864 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr6Q9D864 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr6Q9D864 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr6Q9D864 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr6Q9D864 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms