Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W7

Cd164l2, CD164 sialomucin-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd164l2Q9D6W7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd164l2Q9D6W7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd164l2Q9D6W7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd164l2Q9D6W7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd164l2Q9D6W7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd164l2Q9D6W7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd164l2Q9D6W7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd164l2Q9D6W7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd164l2Q9D6W7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd164l2Q9D6W7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd164l2Q9D6W7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd164l2Q9D6W7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd164l2Q9D6W7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd164l2Q9D6W7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd164l2Q9D6W7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd164l2Q9D6W7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd164l2Q9D6W7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd164l2Q9D6W7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd164l2Q9D6W7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms