Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6U8

Fam162a, Protein FAM162A, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam162aQ9D6U8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam162aQ9D6U8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam162aQ9D6U8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam162aQ9D6U8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam162aQ9D6U8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms