Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubxn11Q9D572 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ubxn11Q9D572 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ubxn11Q9D572 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubxn11Q9D572 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubxn11Q9D572 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubxn11Q9D572 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubxn11Q9D572 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubxn11Q9D572 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubxn11Q9D572 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubxn11Q9D572 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubxn11Q9D572 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ubxn11Q9D572 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ubxn11Q9D572 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ubxn11Q9D572 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ubxn11Q9D572 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubxn11Q9D572 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubxn11Q9D572 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubxn11Q9D572 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubxn11Q9D572 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ubxn11Q9D572 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ubxn11Q9D572 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ubxn11Q9D572 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubxn11Q9D572 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubxn11Q9D572 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubxn11Q9D572 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubxn11Q9D572 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ubxn11Q9D572 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn11Q9D572 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ubxn11Q9D572 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn11Q9D572 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn11Q9D572 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn11Q9D572 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn11Q9D572 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn11Q9D572 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn11Q9D572 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn11Q9D572 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms