Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B2

Ttc25, Tetratricopeptide repeat protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc25Q9D4B2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc25Q9D4B2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc25Q9D4B2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc25Q9D4B2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc25Q9D4B2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc25Q9D4B2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc25Q9D4B2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc25Q9D4B2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc25Q9D4B2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc25Q9D4B2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc25Q9D4B2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc25Q9D4B2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms