Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D454 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D454 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D454 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D454 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D454 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D454 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D454 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D454 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D454 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D454 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D454 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D454 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D454 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D454 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D454 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D454 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D454 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9D454 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D454 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D454 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D454 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D454 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D454 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D454 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D454 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D454 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D454 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D454 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D454 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D454 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D454 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D454 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q9D454 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D454 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D454 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D454 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D454 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D454 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D454 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D454 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D454 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D454 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D454 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D454 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D454 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D454 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D454 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D454 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D454 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D454 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D454 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D454 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D454 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D454 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D454 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D454 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D454 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D454 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D454 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D454 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D454 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D454 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D454 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D454 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D454 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D454 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D454 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D454 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D454 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D454 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D454 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D454 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D454 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D454 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D454 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D454 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D454 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D454 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D454 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9D454 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D454 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D454 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D454 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D454 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D454 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D454 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D454 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D454 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D454 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D454 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D454 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D454 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D454 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D454 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D454 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D454 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D454 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D454 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D454 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms