Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt20Q9D312 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt20Q9D312 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt20Q9D312 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt20Q9D312 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms