Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ToporslQ9D2F8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ToporslQ9D2F8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ToporslQ9D2F8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ToporslQ9D2F8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ToporslQ9D2F8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ToporslQ9D2F8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ToporslQ9D2F8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ToporslQ9D2F8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms