Protein–RNA interactions for Protein: Q9D219

Bcl9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl9Q9D219 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Bcl9Q9D219 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Bcl9Q9D219 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Bcl9Q9D219 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,11
Bcl9Q9D219 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Bcl9Q9D219 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Bcl9Q9D219 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Bcl9Q9D219 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Bcl9Q9D219 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Bcl9Q9D219 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Bcl9Q9D219 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34,46■■■■□ 3,11
Bcl9Q9D219 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Bcl9Q9D219 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Bcl9Q9D219 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Bcl9Q9D219 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Bcl9Q9D219 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Bcl9Q9D219 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Bcl9Q9D219 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Bcl9Q9D219 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Bcl9Q9D219 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Bcl9Q9D219 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Bcl9Q9D219 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Bcl9Q9D219 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Bcl9Q9D219 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Bcl9Q9D219 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Bcl9Q9D219 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Bcl9Q9D219 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34,38■■■■□ 3,09
Bcl9Q9D219 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Bcl9Q9D219 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Bcl9Q9D219 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Bcl9Q9D219 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Bcl9Q9D219 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Bcl9Q9D219 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Bcl9Q9D219 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Bcl9Q9D219 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
Bcl9Q9D219 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Bcl9Q9D219 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Bcl9Q9D219 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Bcl9Q9D219 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Bcl9Q9D219 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Bcl9Q9D219 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34,32■■■■□ 3,08
Bcl9Q9D219 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34,31■■■■□ 3,08
Bcl9Q9D219 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Bcl9Q9D219 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Bcl9Q9D219 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34,3■■■■□ 3,08
Bcl9Q9D219 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34,3■■■■□ 3,08
Bcl9Q9D219 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34,3■■■■□ 3,08
Bcl9Q9D219 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Bcl9Q9D219 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Bcl9Q9D219 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Bcl9Q9D219 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Bcl9Q9D219 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Bcl9Q9D219 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Bcl9Q9D219 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Bcl9Q9D219 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Bcl9Q9D219 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Bcl9Q9D219 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Bcl9Q9D219 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Bcl9Q9D219 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Bcl9Q9D219 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34,23■■■■□ 3,07
Bcl9Q9D219 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Bcl9Q9D219 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
Bcl9Q9D219 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Bcl9Q9D219 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34,17■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Bcl9Q9D219 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Bcl9Q9D219 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Bcl9Q9D219 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Bcl9Q9D219 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Bcl9Q9D219 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Bcl9Q9D219 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Bcl9Q9D219 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34,06■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34,06■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34,02■■■■□ 3,04
Bcl9Q9D219 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34,01■■■■□ 3,03
Bcl9Q9D219 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,01■■■■□ 3,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms