Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem88Q9D0N8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem88Q9D0N8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms