Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thumpd2Q9CZB3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thumpd2Q9CZB3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thumpd2Q9CZB3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thumpd2Q9CZB3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms