Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prelid3bQ9CYY7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prelid3bQ9CYY7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prelid3bQ9CYY7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prelid3bQ9CYY7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prelid3bQ9CYY7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prelid3bQ9CYY7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prelid3bQ9CYY7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prelid3bQ9CYY7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prelid3bQ9CYY7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prelid3bQ9CYY7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prelid3bQ9CYY7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prelid3bQ9CYY7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prelid3bQ9CYY7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prelid3bQ9CYY7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prelid3bQ9CYY7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prelid3bQ9CYY7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prelid3bQ9CYY7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prelid3bQ9CYY7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prelid3bQ9CYY7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prelid3bQ9CYY7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prelid3bQ9CYY7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prelid3bQ9CYY7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prelid3bQ9CYY7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prelid3bQ9CYY7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prelid3bQ9CYY7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prelid3bQ9CYY7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prelid3bQ9CYY7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prelid3bQ9CYY7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prelid3bQ9CYY7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prelid3bQ9CYY7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prelid3bQ9CYY7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prelid3bQ9CYY7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prelid3bQ9CYY7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prelid3bQ9CYY7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prelid3bQ9CYY7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prelid3bQ9CYY7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prelid3bQ9CYY7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prelid3bQ9CYY7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prelid3bQ9CYY7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms