Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssu72Q9CY97 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssu72Q9CY97 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssu72Q9CY97 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssu72Q9CY97 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms