Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx7Q9CY18 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Snx7Q9CY18 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx7Q9CY18 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx7Q9CY18 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx7Q9CY18 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx7Q9CY18 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx7Q9CY18 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx7Q9CY18 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx7Q9CY18 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx7Q9CY18 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx7Q9CY18 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx7Q9CY18 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx7Q9CY18 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx7Q9CY18 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx7Q9CY18 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx7Q9CY18 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx7Q9CY18 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 844.1 ms