Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXS4

Cenpv, Centromere protein V, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpvQ9CXS4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CenpvQ9CXS4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpvQ9CXS4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CenpvQ9CXS4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CenpvQ9CXS4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CenpvQ9CXS4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CenpvQ9CXS4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CenpvQ9CXS4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CenpvQ9CXS4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CenpvQ9CXS4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CenpvQ9CXS4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms