Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rbm8aQ9CWZ3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rbm8aQ9CWZ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbm8aQ9CWZ3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbm8aQ9CWZ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rbm8aQ9CWZ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rbm8aQ9CWZ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rbm8aQ9CWZ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rbm8aQ9CWZ3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbm8aQ9CWZ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbm8aQ9CWZ3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbm8aQ9CWZ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm8aQ9CWZ3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm8aQ9CWZ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbm8aQ9CWZ3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rbm8aQ9CWZ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbm8aQ9CWZ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbm8aQ9CWZ3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbm8aQ9CWZ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbm8aQ9CWZ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbm8aQ9CWZ3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbm8aQ9CWZ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbm8aQ9CWZ3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbm8aQ9CWZ3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbm8aQ9CWZ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbm8aQ9CWZ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rbm8aQ9CWZ3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rbm8aQ9CWZ3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rbm8aQ9CWZ3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rbm8aQ9CWZ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rbm8aQ9CWZ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rbm8aQ9CWZ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbm8aQ9CWZ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms