Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MINDY3Q9CV28 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MINDY3Q9CV28 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MINDY3Q9CV28 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MINDY3Q9CV28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MINDY3Q9CV28 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms