Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tspo2Q9CRZ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspo2Q9CRZ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspo2Q9CRZ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms