Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CR55 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CR55 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CR55 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CR55 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CR55 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CR55 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CR55 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CR55 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CR55 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CR55 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CR55 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CR55 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CR55 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CR55 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CR55 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CR55 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CR55 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CR55 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CR55 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CR55 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CR55 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CR55 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CR55 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CR55 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CR55 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CR55 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CR55 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CR55 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CR55 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CR55 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CR55 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9CR55 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9CR55 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9CR55 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9CR55 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CR55 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9CR55 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9CR55 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9CR55 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9CR55 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9CR55 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9CR55 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9CR55 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CR55 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CR55 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CR55 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CR55 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9CR55 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CR55 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CR55 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CR55 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CR55 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CR55 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CR55 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CR55 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CR55 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CR55 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CR55 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CR55 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CR55 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CR55 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CR55 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CR55 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CR55 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CR55 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CR55 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CR55 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CR55 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CR55 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CR55 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CR55 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9CR55 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9CR55 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CR55 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CR55 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CR55 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CR55 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CR55 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CR55 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CR55 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CR55 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CR55 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CR55 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CR55 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CR55 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CR55 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CR55 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CR55 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CR55 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CR55 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CR55 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CR55 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CR55 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CR55 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CR55 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CR55 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CR55 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CR55 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CR55 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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