Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CQM1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CQM1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CQM1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CQM1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CQM1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CQM1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CQM1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CQM1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CQM1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CQM1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CQM1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CQM1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CQM1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CQM1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CQM1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CQM1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CQM1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CQM1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CQM1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9CQM1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CQM1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQM1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQM1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQM1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQM1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQM1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQM1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CQM1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CQM1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CQM1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CQM1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CQM1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CQM1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CQM1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CQM1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CQM1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CQM1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms