Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer1Q9CQL2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccer1Q9CQL2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccer1Q9CQL2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccer1Q9CQL2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer1Q9CQL2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer1Q9CQL2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccer1Q9CQL2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccer1Q9CQL2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccer1Q9CQL2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccer1Q9CQL2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccer1Q9CQL2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccer1Q9CQL2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer1Q9CQL2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer1Q9CQL2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer1Q9CQL2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccer1Q9CQL2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccer1Q9CQL2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccer1Q9CQL2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccer1Q9CQL2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer1Q9CQL2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer1Q9CQL2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer1Q9CQL2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccer1Q9CQL2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccer1Q9CQL2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccer1Q9CQL2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccer1Q9CQL2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccer1Q9CQL2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccer1Q9CQL2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccer1Q9CQL2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccer1Q9CQL2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccer1Q9CQL2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccer1Q9CQL2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms