Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sar1bQ9CQC9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sar1bQ9CQC9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sar1bQ9CQC9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sar1bQ9CQC9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sar1bQ9CQC9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms