Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpd52l3Q9CQ14 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpd52l3Q9CQ14 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpd52l3Q9CQ14 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpd52l3Q9CQ14 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpd52l3Q9CQ14 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.9 ms