Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms