Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rwdd4Q9CPR1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rwdd4Q9CPR1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rwdd4Q9CPR1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rwdd4Q9CPR1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rwdd4Q9CPR1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rwdd4Q9CPR1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rwdd4Q9CPR1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rwdd4Q9CPR1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rwdd4Q9CPR1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rwdd4Q9CPR1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rwdd4Q9CPR1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rwdd4Q9CPR1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rwdd4Q9CPR1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rwdd4Q9CPR1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd4Q9CPR1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd4Q9CPR1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rwdd4Q9CPR1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rwdd4Q9CPR1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd4Q9CPR1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd4Q9CPR1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rwdd4Q9CPR1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rwdd4Q9CPR1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rwdd4Q9CPR1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rwdd4Q9CPR1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rwdd4Q9CPR1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rwdd4Q9CPR1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rwdd4Q9CPR1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms