Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lpin3Q99PI4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lpin3Q99PI4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lpin3Q99PI4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lpin3Q99PI4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lpin3Q99PI4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lpin3Q99PI4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lpin3Q99PI4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lpin3Q99PI4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lpin3Q99PI4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lpin3Q99PI4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms