Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acss1Q99NB1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acss1Q99NB1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acss1Q99NB1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acss1Q99NB1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acss1Q99NB1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Acss1Q99NB1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acss1Q99NB1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acss1Q99NB1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acss1Q99NB1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acss1Q99NB1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acss1Q99NB1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acss1Q99NB1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acss1Q99NB1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Acss1Q99NB1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acss1Q99NB1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acss1Q99NB1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acss1Q99NB1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acss1Q99NB1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acss1Q99NB1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acss1Q99NB1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8792.8 ms