Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col25a1Q99MQ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col25a1Q99MQ5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col25a1Q99MQ5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col25a1Q99MQ5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col25a1Q99MQ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col25a1Q99MQ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col25a1Q99MQ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col25a1Q99MQ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Col25a1Q99MQ5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col25a1Q99MQ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col25a1Q99MQ5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col25a1Q99MQ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col25a1Q99MQ5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col25a1Q99MQ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col25a1Q99MQ5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col25a1Q99MQ5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms