Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tlr3Q99MB1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tlr3Q99MB1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlr3Q99MB1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlr3Q99MB1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlr3Q99MB1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tlr3Q99MB1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tlr3Q99MB1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr3Q99MB1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tlr3Q99MB1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlr3Q99MB1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr3Q99MB1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms