Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk5rap3Q99LM2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk5rap3Q99LM2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk5rap3Q99LM2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.8 ms