Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnpo2Q99LG2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnpo2Q99LG2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnpo2Q99LG2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnpo2Q99LG2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnpo2Q99LG2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnpo2Q99LG2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnpo2Q99LG2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnpo2Q99LG2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnpo2Q99LG2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnpo2Q99LG2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnpo2Q99LG2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnpo2Q99LG2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnpo2Q99LG2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnpo2Q99LG2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnpo2Q99LG2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnpo2Q99LG2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnpo2Q99LG2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnpo2Q99LG2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnpo2Q99LG2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnpo2Q99LG2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnpo2Q99LG2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnpo2Q99LG2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnpo2Q99LG2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnpo2Q99LG2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnpo2Q99LG2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnpo2Q99LG2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnpo2Q99LG2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnpo2Q99LG2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnpo2Q99LG2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnpo2Q99LG2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnpo2Q99LG2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnpo2Q99LG2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnpo2Q99LG2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnpo2Q99LG2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnpo2Q99LG2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnpo2Q99LG2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnpo2Q99LG2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnpo2Q99LG2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnpo2Q99LG2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnpo2Q99LG2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnpo2Q99LG2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnpo2Q99LG2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnpo2Q99LG2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnpo2Q99LG2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnpo2Q99LG2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnpo2Q99LG2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnpo2Q99LG2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnpo2Q99LG2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnpo2Q99LG2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnpo2Q99LG2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms