Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nmd3Q99L48 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nmd3Q99L48 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nmd3Q99L48 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nmd3Q99L48 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nmd3Q99L48 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms