Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q99KU6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q99KU6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q99KU6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q99KU6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q99KU6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q99KU6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q99KU6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q99KU6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q99KU6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q99KU6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q99KU6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q99KU6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q99KU6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q99KU6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q99KU6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q99KU6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q99KU6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q99KU6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q99KU6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q99KU6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q99KU6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q99KU6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q99KU6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q99KU6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q99KU6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q99KU6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q99KU6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q99KU6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q99KU6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q99KU6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q99KU6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q99KU6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q99KU6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q99KU6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q99KU6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q99KU6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q99KU6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q99KU6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q99KU6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q99KU6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q99KU6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q99KU6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q99KU6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q99KU6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q99KU6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q99KU6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q99KU6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q99KU6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q99KU6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q99KU6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q99KU6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q99KU6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q99KU6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q99KU6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q99KU6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q99KU6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q99KU6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q99KU6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q99KU6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q99KU6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q99KU6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q99KU6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q99KU6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q99KU6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q99KU6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q99KU6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q99KU6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q99KU6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q99KU6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q99KU6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q99KU6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q99KU6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q99KU6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q99KU6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q99KU6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q99KU6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q99KU6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q99KU6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q99KU6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q99KU6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q99KU6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q99KU6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q99KU6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q99KU6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q99KU6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q99KU6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q99KU6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q99KU6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q99KU6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q99KU6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q99KU6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q99KU6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q99KU6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q99KU6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q99KU6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q99KU6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q99KU6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q99KU6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q99KU6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms