Protein–RNA interactions for Protein: Q99K99

Uncharacterized protein C4orf19 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99K99 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Q99K99 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q99K99 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q99K99 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q99K99 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q99K99 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q99K99 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q99K99 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Q99K99 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q99K99 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q99K99 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q99K99 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q99K99 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q99K99 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q99K99 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q99K99 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q99K99 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q99K99 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q99K99 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q99K99 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q99K99 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q99K99 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q99K99 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q99K99 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q99K99 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q99K99 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q99K99 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q99K99 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q99K99 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q99K99 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q99K99 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q99K99 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q99K99 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q99K99 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q99K99 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q99K99 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q99K99 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q99K99 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q99K99 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q99K99 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q99K99 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q99K99 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q99K99 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q99K99 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q99K99 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q99K99 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q99K99 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q99K99 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q99K99 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q99K99 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q99K99 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q99K99 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q99K99 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q99K99 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q99K99 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99K99 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99K99 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99K99 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q99K99 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q99K99 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q99K99 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q99K99 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q99K99 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q99K99 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q99K99 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q99K99 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q99K99 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Q99K99 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q99K99 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Q99K99 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q99K99 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q99K99 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q99K99 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q99K99 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q99K99 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q99K99 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q99K99 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q99K99 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q99K99 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q99K99 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q99K99 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q99K99 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q99K99 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q99K99 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q99K99 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q99K99 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99K99 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99K99 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99K99 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99K99 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99K99 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99K99 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q99K99 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q99K99 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q99K99 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q99K99 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q99K99 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q99K99 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q99K99 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q99K99 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms