Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdk9Q99J95 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdk9Q99J95 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk9Q99J95 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk9Q99J95 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms