Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sntg2Q925E0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sntg2Q925E0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sntg2Q925E0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sntg2Q925E0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sntg2Q925E0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sntg2Q925E0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sntg2Q925E0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sntg2Q925E0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sntg2Q925E0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sntg2Q925E0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sntg2Q925E0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sntg2Q925E0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sntg2Q925E0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sntg2Q925E0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sntg2Q925E0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sntg2Q925E0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sntg2Q925E0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sntg2Q925E0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sntg2Q925E0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sntg2Q925E0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sntg2Q925E0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sntg2Q925E0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sntg2Q925E0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sntg2Q925E0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sntg2Q925E0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sntg2Q925E0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sntg2Q925E0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sntg2Q925E0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sntg2Q925E0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sntg2Q925E0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sntg2Q925E0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sntg2Q925E0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sntg2Q925E0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sntg2Q925E0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sntg2Q925E0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sntg2Q925E0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms