Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smc6Q924W5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smc6Q924W5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc6Q924W5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms