Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss28Q924N9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss28Q924N9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss28Q924N9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss28Q924N9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prss28Q924N9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prss28Q924N9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prss28Q924N9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss28Q924N9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prss28Q924N9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prss28Q924N9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prss28Q924N9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms